小智等人来到了山势险峻的利亚多村。最近在这个村庄出现了罕见的灾祸神奇宝贝阿勃梭鲁，村民们担心可能发生的灾祸而困扰不已。村子的少年阿德说他的哥哥小聪知道这灾祸并不是阿勃梭鲁所引起的，他离开村子去探明真相，小智等人决定陪伴阿德寻找小聪。另一方面，火箭队伪装成阿勃梭鲁猎人，寻找机会企图夺走皮卡丘。