以第八个徽章为目标的小智等人在前往目的地琉璃市的途中，路过了一座岛屿。他们正想在其中一家店用餐，在店里偶然遇见了四天王之一的源治，这让小智他们兴奋不已。源治的工作是船长，小智在他的带领下见识了巨大的帆船，源治还邀请小智来一场神奇宝贝对战比赛。面对这场与四天王的对决，小智摩拳擦掌，正想大显身手，可是...