在和雨忍的半藏对决中，自来也、纲手和大蛇丸被半藏称为木叶三忍。战斗结束后不久，自来也碰见了长门、小南和弥彦。面对弥彦渴望学忍术的请求，自来也不顾纲手的反对，决定教给三个孩子忍术，他觉得这是命运的趋势。在教给三个孩子学习忍术的过程中，自来也发现长门居然具有轮回眼，他想起了那条寓言，他的弟子将为忍者世界带来重大的变革。