高斯高特曼被打败后，为了防止实体混沌病毒再次出现，防卫部邀请青年精英队与他们合作；另一方面，数千年一遇的日全食也即将来临。武藏得知联合作战已是板上钉钉的事，他明白即便这样也没可能打败实体混沌病毒，除非唤醒高斯奥特曼，他到处寻找着高斯高特曼。当武藏寻得的温柔、刚强和勇气集结之时，金灿灿的高斯奥特曼也迎来了新形态诞生。