为了前往睿智湖，小智一行人搭上了列车，在车上认识了一名叫做帅哥的男子。有点糊涂的帅哥买了太多特产车站便当，在车上把便当分送给乘客。小智他们就跟着送便当的帅哥一起到了驾驶室，那里有灯神奇宝贝电龙在帮忙驾驶。就在大家因为神奇宝贝的活跃而感动的时候，发现前方的讯号灯变成红色，列车只能紧急停车。